はじめに (リンク集)
0. はじめに (リンク集)
近年、各種生物のゲノムの塩基配列が次々と決定され、膨大な量の塩基配列情報がデータベース化されている。また、塩基配列情報だけでなく、タンパク質のアミノ酸配列やその立体構造に関する情報などもインターネットを通じて容易に利用することが可能であり、今日では研究を行う上でこれらの解析は必要不可欠なものとなっている。さらに、ゲノム情報を利用して生物の機能を研究する、いわゆるポストゲノム研究においては、ゲノムからどのような情報を引き出すか (データマイニング) がポイントとなる。このように膨大な情報の中から必要なものを得るための手法「バイオインフォマティクス」を身につけることは非常に重要となってくる。そこで、今回の演習では、各自実際にインターネットを利用した情報解析を試みてもらう。インターネット上にはオンラインでバイオ研究を進める上で必要な解析を行えるサイトが数多くあり、それらのリンクを集めたリンク集を利用すると大変便利である。以下にそのようなリンク集の一例を示す。
- 分子生物学研究用ツール集
- http://www.yk.rim.or.jp/%7eaisoai/molbio-j.html
- Pedro's BioMolecular Research Tools
- http://www.public.iastate.edu/%7epedro/rt_1.html
- Paul N. Hengen's Molecular Biology Homepage
- http://www-lmmb.ncifcrf.gov/%7epnh/
- All-in-One Seq Analyzer
- http://hp.vector.co.jp/authors/VA007849/blast.html
- BioSurf
- http://www.phschool.com/science/biosurf/
- ExPASy Molecular Biology Server
- http://www.expasy.org/
- ゲノムネット WWW サーバー
- http://www.genome.jp/Japanese/
今回は主に "分子生物学研究用ツール集" を利用して、解析を行う。