研究業績
Laboratory of Molecular Epigenetics for Germline Development
Department of Bioscience, School of Science and Technology
Kwansei Gakuin University
著書

1.栗本一基, 山路剛史, 関 由行, 斎藤通紀, 哺乳類の生殖細胞形成を制御する分子機構

実験医学2月号, 羊土社, 2009


2.大日向康秀, 栗本一基, 薮田幸宏, 関 由行, 斎藤通紀

単一細胞遺伝子発現解析から明らかとなった生殖細胞形成・分化の分子機構, 生殖細胞の発生・エピジェネティクスと再プログラム化,共立出版, 2007


3.関 由行,斎藤通紀.細胞核の世界,蛋白質核酸酵素,10月増刊, 2052-2059, 2006


4.関 由行,Suico, MA.,甲斐広文.転写因子MEF: ガン治療への応用,医学の歩み,207,1,2003


5.関 由行,松居靖久.生殖系列におけるエピジェネティックのプログラム.実験医学,7月増刊号,2003

招待講演

1.関 由行, 生命の連続性を保証する生殖細胞特異的なエピゲノム調節とその破綻,文部科学省・大学教育改革支援プログラム「社会の要求に応える動物生命工学の実践教育」, 和歌山, 2009年11月

2.関 由行, 生命の連続性を保証する生殖細胞特異的なエピゲノム調節とその破綻, 熊薬若手研究者シンポジウム, 熊本, 2009年10月

3.関 由行, 生殖細胞によるエピゲノム制御を介した分化全能性獲得機構の解明, 新学術領域「配偶子幹細胞制御機構」セミナー, 横浜, 2009年5月

4.関 由行, Epigenetic reprogramming associated with specification and early development of germ cells in mice. 熊本大学グローバルCOE研究会, 熊本, 2008年2月

5.関 由行,斎藤通紀,マウス始原生殖細胞によるゲノム修飾の再構成と全能性の再獲得,分子生物学会2006フォーラム,名古屋,2006年12月

6.関 由行, 全能性に関わる始原生殖細胞の核内基盤の解明, 熊本大学21世紀COE研究会, 熊本, 2006年1月

7. 関 由行,斎藤通紀,個体発生能に関与する始原生殖細胞の核内基盤の解明,第2回クロマチン・フロンティアーズ・ジャパンセミナー,京都,2005年11月

8.関 由行,松居靖久.マウス始原生殖細胞の発生,分化におけるクロマチン修飾の解析,第26回日本分子生物学会年会,神戸,2003年12月

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  1. 1.Okashita N#, Kumaki Y#, Ebi K#, Nishi M, Okamoto Y, Nakayama M, Hashimoto S, Nakamura T, Sugasawa K, Kojima N, Takada T, Okano M, Seki Y* (2014) PRDM14 promotes active DNA demethylation through the Ten-eleven translocation (TET)-mediated base excision repair pathway in embryonic stem cells. Development 141: 269-280

 すべての実験を独立後に行った初めての論文。ポスドク時代に同定したPRDM14が、博士課程の時に発見した始原生殖細胞での脱メチル化を制御している可能性を示唆する論文。 神戸新聞、日刊工業新聞に掲載されました。 受理までかなり苦労しましたが、今後数多くの論文に引用されることを期待しています。


  1. 2.Seki Y* and Okashita N, (2014) Epigenetic Reprogramming in Primordial Germ Cells in Mice. Journal of Mammalian Ova Research 30 : 95-100


  1. 3.Seki Y* (2013) Serum-mediated transgenerational effects on sperm: evidence for lamarckian inheritance? Hepatology 57: 1663-1665


  1. 4.Ohno R, Nakayama M, Naruse C, Okashita N, Takano O, Tachibana M, Asano M, Saitou M, Seki Y* (2013) A replication-dependent passive mechanism modulates DNA demethylation in mouse primordial germ cells. Development 140: 2892-2903

 独立後初の責任著者論文。研究室の立ち上げから4年でようやく一報目が受理されました。始原生殖細胞におけるDNA脱メチル化には、DNA複製依存的な機構が関与していることを示した論文。神戸新聞に掲載されました。


  1. 5.Nakashima H, Kimura T, Kaga Y, Nakatani T, Seki Y, Nakamura T, Nakano T (2013) Effects of dppa3 on DNA methylation dynamics during primordial germ cell development in mice. Biol Reprod 88: 125



  1. 6.Ichiyanagi K, Li Y, Watanabe T, Ichiyanagi T, Fukuda K, Kitayama J, Yamamoto Y, Kuramochi-Miyagawa S, Nakano T, Yabuta Y, Seki Y, Saitou M, Sasaki H (2011) Locus- and domain-dependent control of DNA methylation at mouse B1 retrotransposons during male germ cell development. Genome Res 21: 2058-2066


  1. 7.Kurimoto K, Yamaji M, Seki Y, Saitou M (2008) Specification of the germ cell lineage in mice: a process orchestrated by the PR-domain proteins, Blimp1 and Prdm14. Cell Cycle 7: 3514-3518


  1. 8.Yamaji M#, Seki Y#, Kurimoto K#, Yabuta Y, Yuasa M, Shigeta M, Yamanaka K, Ohinata Y, Saitou M (2008) Critical function of Prdm14 for the establishment of the germ cell lineage in mice. Nat Genet 40: 1016-1022

 始原生殖細胞の初期分化過程におけるグローバルなヒストン修飾の変動を制御する責任分子を同定するために、ヒストンメチル化か酵素の機能ドメインであるSET/PRドメインを持つ分子の発現スクリーニングを行い、始原生殖細胞特異的に発現するPrdm14の同定に成功しました。


  1. 9.Seki Y, Yamaji M, Yabuta Y, Sano M, Shigeta M, Matsui Y, Saga Y, Tachibana M, Shinkai Y, Saitou M (2007) Cellular dynamics associated with the genome-wide epigenetic reprogramming in migrating primordial germ cells in mice. Development 134: 2627-2638

 始原生殖細胞が分化過程において、G2アレストとグローバルな転写抑制が観察されることを示しました。


  1. 10.Yabuta Y, Kurimoto K, Ohinata Y, Seki Y, Saitou M (2006) Gene expression dynamics during germline specification in mice identified by quantitative single-cell gene expression profiling. Biol Reprod 75: 705-716


  1. 11.Seki Y*, Hayashi K, Itoh K, Mizugaki M, Saitou M, Matsui Y (2005) Extensive and orderly reprogramming of genome-wide chromatin modifications associated with specification and early development of germ cells in mice. Dev Biol 278: 440-458

 修士課程の時に考えていたアイディアが形になった原点というべき論文。移動課程の始原生殖細胞は性質が変化しないと考えられていましたが、DNA及びH3K9のグローバルな脱メチル化が誘導されることを発見しました。引用回数は既に200回以上で、発表後に評価された論文だと思っています。


  1. 12.Suico MA, Yoshida H, Seki Y, Uchikawa T, Lu Z, Shuto T, Matsuzaki K, Nakao M, Li JD, Kai H (2004) Myeloid Elf-1-like factor, an ETS transcription factor, up-regulates lysozyme transcription in epithelial cells through interaction with promyelocytic leukemia protein. The Journal of biological chemistry 279: 19091-19098


  1. 13.Seki Y, Suico MA, Uto A, Hisatsune A, Shuto T, Isohama Y, Kai H (2002) The ETS transcription factor MEF is a candidate tumor suppressor gene on the X chromosome. Cancer research 62: 6579-6586


  1. 14.Suico MA, Koyanagi T, Ise S, Lu Z, Hisatsune A, Seki Y, Shuto T, Isohama Y, Miyata T, Kai H (2002) Functional dissection of the ETS transcription factor MEF. Biochimica et biophysica acta 1577: 113-120


  1. 15.Lu Z, Kim KA, Suico MA, Uto A, Seki Y, Shuto T, Isohama Y, Miyata T, Kai H (2003) ETS2 is involved in protein kinase C-activated expression of granulocyte-macrophage colony-stimulating factor in human non-small lung carcinoma cell line, A549. Biochemical and biophysical research communications 303: 190-195